SelenoDB
Release 2.0
Chart Advanced
Transcript Report for SPT00001772_2.0
Identity
TranscriptSelenoprotein T (SelT)
SpeciesOchotona princeps (Pika)
Transcript IDSPT00001772
Transcript release2.0
External IDNone
Gene SPG00001677_2.0
Annotation
Prediction method(s)
(Selenoprofiles, Ensembl 68) [Report annotation error]
OrientationForward
Structure gene structure

FeatureCol PromoterCol Coding exonCol Non coding exon (UTR)Col IntronCol SECIS
ResidueCol SecCol Cys or Other

ToolboxFull length   Spliced   5UTR   CDS   3UTR    
Sequence
>SPT00001772_2.0 # Transcript # Selenoprotein T (SelT) # Pika (Ochotona princeps) # Full length # Forward
AGACACATAGCATCTTTCCTGTCAGTCTTCAAACTAGTATTAATAGGCTTAATCATTGTG
GGCAAGGATCCTTTTGCTTTCCTTGGCATGCAAGCTCCTAGCATCTGGCAGTGGGGCCAG
GAAAATAAGGTATGTAACTCGCTGGTGGTAATTGTAGGTTTGTTGGCTGTCAGTGAAAAA
GATGTTAATGACTTTTTAAAATTGCGTATTTGTTACTACTGACTGATGTGTGAAATAGGT
GTTATCTTTGGACAAATCGCTCAGTCTCCCTAGGCTCAGGTGTCACATGTCTATGCTGAG
GGTGATTGGAGCATAAAAGCTACTTATGCAGAGGCTGGGTTCGAAGTCTTTATTTACTTG
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ATATACATAATGTATATGTAATGTATGCCTTCTATACCAAGGAATGAGGAATTACAGATT
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GATTGCTTTGGCTTCCCTTTAAGAAGTGTTGTCTTTTGGAGTTATCTGCCTGGTCTTTAA
GTTTTAGAATGAAAGCCTTTAGCAGACTCATGCATAGCTGTGGTTTTTTTTCCCTTATGG
AACCAGCTGTTTCCAGCATCAGACAGGACAGCATGAGCATGTGCTGCAGGATTCTCTTTA
GTTGAAGTGTCTCTGTGGTTGCTAACAATGTTGATCTGCAGAGAGTTAAAAACTGGAAGT
TGTGTACTTACGCTGTATTAATTAATTCCAAATTATTGTTTGTGCATTTTACTTCTATAT
ATGTAGATGTATGTGCTACTGACTTAATTTAGCAGATTATATTTGAAAGCTGTAGGTTTC
GAGGTGGCTAATTGCGTGATGGTCCCATAAAAGTAGTCTTGGCTTTCCAAGTATTGGAAA
CCCTTATGACATAGCTCCGTCTCATCCGACTGGCCTGGGGGAGATGATTGTCCTCATCCC
CTGTGCAGATCTGTGTTACTTTTTGGAAATGGTTTGCTATGAATGACATTCTCACTATAT
TCTACCTTTAATCCAAGTAAATCTGTAAATTAAGCCTTTTGTCCAACTAGGGGCTTCTTA
GGGAGAGTAAAGATTCGCCTTGAGAAGATGAATGAATGGACTTTAATGTGCTTTCTTGCT
GCTTCTTTGGCTTAAAGTGATTTGTTTGAAACATAAACAGGTTATATTGAACACATGGAG
TTGCTGACTGTTGCGTCACTAGTCCTTTGTGAATTCGTATTAAATGGTGTTTAGAGAATT
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GTGTGTATGTCTATCTTTGTCCCCCTCTCTCTGTCTTTCAAATAAATTAGGAAAAATATT
TTTTTGTGTGTGCTGAACTAGCTAATCTTGCCGTTTAGTTTCATTTTCTATAACTTTGTT
CTTCAGTATATATACAGCTGTGAATTAATACTGCCTTTTTCTTGCTGTGAGTGTATTATC
TGGGCATGTGGAATAGCAGTAATGACCTATATAAAAGCTGTAAGGTAGTCTAGGAAAGAG
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ATGTATGATGGTTTTCTTCTTGAGCAACATGATTGAGAACCAGTGCATGTCAACAGGTGC
ATTTGAAATAACTTTAAAC
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